SISTEMAS METABÓLICOS
ACTIVIDAD INVESTIGADORA
El metabolismo de aminoácidos juega un papel fundamental en la homeostasis de cualquier ser vivo. Clásicamente estas rutas se han estudiado como módulos e incluso como elementos independientes, pero lo cierto es que forma parte de una red metabólica mucho más de la que depende el comportamiento celular y del organismo pluricelular completo. [Expasy Metabolic Pathway]. En animales superiores, por ejemplo, influye en el pH sanguíneo (i.e.: metabolismo de la arginina), la caquexia asociada a la proliferación tumoral y la propia capacidad proliferativa (poliaminas, Gln y Asn), la neurotransmisión (i.e.: Glu y aminas derivadas de aminoácidos catiónicos y aromáticos), respuestas inmunes e inflamatorias (i.e.: histamina, NO), y las múltiples reacciones metabólicas que requieren de metilación como la biosíntesis de poliaminas, esteroles, o la expresión génica (i.e.: S-adenosil metionina y aminoácidos azufrados).
Nuestro grupo tiene una trayectoria de más de 20 años en el estudio del metabolismo de aminoácidos y su papel en procesos fisiopatológicos como el cáncer, la respuesta inmune y una serie de enfermedades raras de origen genético (ver publicaciones representativas de nuestra trayectoria más abajo). En los últimos 6 años, apoyados por las nuevas tecnologías experimentales e “in silicio” propias de la Biología de Sistemas, hemos intentado abordar estos problemas con una estrategia más holista, que pretende revelar nuevas propiedades emergentes a partir de la integración de la información pre-existente y de procesos iterativos de modelado y validación experimental. Se aplican técnicas de modelado y dinámica molecular, de modelado metabólico, de prediccion funcional de proteinas, y de modelado y análisis topológico de redes biológicas que se validan mediante técnicas propias de la Biofísica aplicadas a la Enzimología, el análisis metabólico, técnicas de inmunoreconocimiento, tecnología del DNA recombinante (mutagénesis dirigida, transfección, etc), y nuevas tecnologías de alto rendimiento propias de la genómica funcional (matrices de expresión, de anticuerpos y proteómica).
Todo ello con una doble finalidad:
- generar conocimiento básico sobre nuevas propiedades que no podían conocerse a partir del análisis experimental de los elementos individuales,
- encontrar nuevas dianas más sensibles y específicas para el diagnóstico, pronóstico o tratamiento de las diferentes patologías asociadas a estas rutas metabólicas.
En consonancia con estas hipótesis y estrategias, en los últimos 5 años hemos desarrollado (y/o seguimos desarrollando) distintos proyectos propios del grupo o integrados en otras redes cooperativas nacionales o internacionales.
PROYECTOS Y REDES COOPERATIVAS DE LOS ÚLTIMOS 5 AÑOS:
 |
 |
 |
 |
 |
 |
 |
Título del proyecto: Hacia una visión integradora del metabolismo en células de mamíferos: Aplicaciones en enfermedades raras y emergentes.
Entidad financiadora: Ministerio de Economía y Competitividad (SAF2011-26518).
Entidades participantes: UMA y Univ. Eastern Finland
Investigador responsable: Sánchez Jiménez F.
Título del proyecto: Análisis del efecto de chaperonas farmacológicas sobre proteinas mutantes en la enfermedad de Gaucher.
Entidad financiadora: CIBER de Enfermedades Raras. Instituto de Salud Carlos III (Ministerio de Sanidad y Consumo).
Entidades participantes: CIBER-ER, UMA y Hospital Universitario Miguel Servet
Investigador responsable: Giraldo P.
Título del proyecto: Network of excellence: systems microscopy- a key enabling methodology for next-generation systems biology.
Entidad financiadora: UE. FP7-HEALTH-2010-258068.
Investigador responsable(en la UMA): García-Ranea JA
Título del proyecto: Una propuesta de la Biología de Sistemas para el estudio transversal de enfermedades raras y emergentes.
Entidad Financiadora: Plan Andaluz de Investigación, Desarrollo e Innovación (Proyecto de Excelencia 2010).
Investigador responsable: Sánchez Jiménez F.
Título del proyecto: Predicción y modelado de redes de proteínas aplicado al estudio de enfermedades raras en humanos y su tratamiento.
Entidad financiadora: Ministerio de Ciencia e Innovación (MICINN). SAF2009-09839
Entidades participantes: CIBER-ER y University College London
Duración, desde: 2010 hasta: Hoy
Entidades participantes: CIBER-ER y la University College London
Investigador responsable: García-Ranea JA
Título del proyecto: Recent advances in histamine receptors H4R research.
Entidad financiadora: COST Action BM0806
Entidades participantes: 7 paises de la UE
Duración, desde: 2009 hasta: 2012
Investigador responsable: Sánchez-Jiménez F
Número de investigadores que apoyaban la petición: 7
Título del proyecto: Avances hacia una visión sistémica del metabolismo de aminoácidos catiónicos en células de mamíferos. Aplicaciones en Biomedicina.
Entidad financiadora: Ministerio de Ciencia e Innovación (MICINN). SAF2008-02522
Entidades participantes: UMA
Duración, desde: 2009 hasta: 2011
Investigador responsable: Sánchez-Jiménez F
Número de investigadores que apoyaban la petición: 8
Título del proyecto: Caracterización Estructural y funcional del transportador de hormona tiroidea MCT8.
Entidad financiadora: CIBER de Enfermedades Raras. Instituto de Salud Carlos III (Ministerio de Sanidad y Consumo)
Duración, desde: 2009 hasta: hoy
Investigador responsable: Sánchez-Jiménez F
Número de investigadores que apoyaban la petición: >7
Título del proyecto: Desarrollo y Aplicación de Estrategias Biocomputacionales para la caracterización de las bases moleculares de enfermedades metabólicas hereditarias.
Entidad financiadora: CIBER de Enfermedades Raras. Instituto de Salud Carlos III (Ministerio de Sanidad y Consumo)
Duración, desde: 2009 hasta: hoy
Investigador responsable: Sánchez-Jiménez F
Número de investigadores que apoyaban la petición: >7
Título del proyecto: Estudio de endoglina como nueva diana de las terapias relacionadas con angiogénesis.
Entidad financiadora: CIBER de Enfermedades Raras. Instituto de Salud Carlos III (Ministerio de Sanidad y Consumo)
Entidades participantes: Instituto de Investigaciones Biomédicas (CSIC-UAM)-UMA
Duración, desde: 2008 hasta: 2009
Investigador responsable: Dr. Bernabeu C, Dr. Sánchez-Jiménez F
Número de investigadores que apoyaban la petición: >7
Título del proyecto: Predicting new targets involved in human angiogenesis.
Entidad financiadora: ENFIN (FPVI, DGXII, UE)
Entidades participantes: UMA, UCL, NCB, EGEEN
Duración, desde: 2008 hasta: 2009
Investigadora responsable: F. Sánchez-Jiménez
Número de investigadores que apoyaban la petición: 3
Título del proyecto: Integración y modelado del metabolismo y efectos biológicos de las aminas biógenas, biomoléculas directamente implicadas en enfermedades raras y emergentes.
Entidad financiadora: Fundación Ramón Areces
Entidades participantes: UMA
Duración, desde: 2007 hasta: 2010
Investigador responsable: Miguel Ángel Medina
Número de investigadores participantes: 9
Título del proyecto: Análisis sistémico de la canalización metabólica: definiendo el metabolonoma mínimo de mamíferos (MMM).
Entidad financiadora: Proyecto de Excelencia de la Junta de Andalucía, FEDER. CVI-02999
Entidades participantes: UMA
Duración, desde: 2007 hasta: 2011
Investigadora responsable: F. Sánchez-Jiménez
Número de investigadores que apoyaban la petición: 5
Título del proyecto: Biología de Sistemas: de la Genómica a la Biocomputación (Plan Propio de Ayudas para la constitución de Redes Temáticas Locales de la UMA).
Entidad financiadora: UMA
Entidades participantes: UMA
Duración, desde: 2007 hasta: 2010
Investigador Coordinador: Enrique Viguera Mínguez
Número de investigadores participantes:
Título del proyecto: Proyecto piloto de desarrollo de herramientas predictivas de cambios en los flujos metabólicos a partir de datos experimentales de Genómica Funcional.
Entidad financiadora: CIBER de Enfermedades Raras. Instituto de Salud Carlos III (Ministerio de Sanidad y Consumo)
Entidades participantes: Principe Felipe (Valencia)-Universidad de Málaga
Duración, desde: 2007 hasta: 2008
Investigadores responsables: J. Dopazo y F. Sánchez-Jiménez (IP)
Número de investigadores que apoyaban la petición: > 7
Título del proyecto: CIBER de Enfermedades Raras.
Entidad financiadora: Instituto de Salud Carlos III (Ministerio de Sanidad y Consumo)
Entidades participantes: >15 centros de investigación de toda España
Duración, desde: 2006 hasta: hoy
Investigador Responsable: Francesc Palau (IP en la UMA: F. Sánchez-Jimenez)
Número de Investigadores que apoyaban la petición: >100 (7 en la UMA)
Publicaciones representativas de la trayectoria del grupo (anterior a 2005).
ENLACES DE INTERÉS Y COLABORACIONES:
CIBER-ER - KHAOS - UCL - COST - CSIC - REMA - ICIII - MICINN - UMA - PAI
Diseñado por Proyecta Científica
